amphiBR

Pacote R com dataset da publicação oficial da Lista de Anfíbios do Brasil publicada pela Sociedade Brasileira de Herpetologia

Autor

Paulo Barros de Abreu Junior, Diogo Provete, Maurício Vancine, Juliana Zina

amphiBR

Pacote R com dataset da publicação oficial da Lista de Anfíbios do Brasil publicada pela Sociedade Brasileira de Herpetologia.

O dataset foi extraído da publicação por Segalla et al. (2021) na Revista Brasileira de Herpetologia, e disponível também no link https://zenodo.org/record/4716176

O objetivo deste pacote é facilitar a geração de listas de espécie para projetos, inventários de fauna, ou qualquer outro tipo de documento.

Dúvidas, críticas e sugestões são sempre bem-vindas!

Instalação

O pacote pode ser instalado diretamente do github:

# install.packages("devtools")
devtools::install_github("paulobarros/amphiBR")
library(amphiBR)

Dataset

O dataset consiste de 1188 linhas com 49 colunas:

order - Ordem

family - Família

subfamily - Subfamília

sp_num - Número da espécie na lista

genus - Gênero

epithet - Epíteto específico

species - Nome científico

author - Autoria

status - Observações

category - Cateogoria de Ameaça pela Portaria MMA 300/2022

O dataset é automaticamente carregado junto com o pacote e pode ser acessado diretamente:

> segalla2021
# A tibble: 1,188 × 49
   species_id order family  subfamily genus epithet species author status common_name_br category endemic_br    AC    AL    AP    AM    BA
        <dbl> <chr> <chr>   <chr>     <chr> <chr>   <chr>   <chr>  <chr>  <chr>          <chr>    <chr>      <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
 1          1 Anura Alloph… NA        Allo… relicta Alloph… Caram… NA     NA             DD       Yes            0     0     0     0     1
 2          2 Anura Alloph… NA        Allo… resple… Alloph… Castr… NA     Resplendent F… LC       No             0     0     0     1     0
 3          3 Anura Alloph… NA        Allo… ruthve… Alloph… Gaige… NA     NA             LC       No             0     0     1     1     0
 4          4 Anura Alsodi… NA        Limn… macrog… Limnom… (Dumé… NA     Rãzinha-de-co… LC       No             0     0     0     0     0
 5          5 Anura Aromob… Allobati… Allo… bacurau Alloba… Simõe… NA     NA             LC       Yes            0     0     0     1     0
 6          6 Anura Aromob… Allobati… Allo… brunne… Alloba… (Cope… NA     Chapada Rocke… NT       Yes            0     0     0     0     0
 7          7 Anura Aromob… Allobati… Allo… caerul… Alloba… (Lima… NA     NA             LC       Yes            0     0     0     1     0
 8          8 Anura Aromob… Allobati… Allo… caldwe… Alloba… Lima,… recen… NA             NA       NA            NA    NA    NA    NA    NA
 9          9 Anura Aromob… Allobati… Allo… carajas Alloba… Simõe… NA     NA             NA       NA            NA    NA    NA    NA    NA
10         10 Anura Aromob… Allobati… Allo… conspi… Alloba… (Mora… NA     NA             LC       No             1     0     0     0     0
# ℹ 1,178 more rows
# ℹ 32 more variables: CE <dbl>, DF <dbl>, ES <dbl>, GO <dbl>, MA <dbl>, MT <dbl>, MS <dbl>, MG <dbl>, PA <dbl>, PB <dbl>, PR <dbl>,
#   PE <dbl>, PI <dbl>, RJ <dbl>, RN <dbl>, RS <dbl>, RO <dbl>, RR <dbl>, SC <dbl>, SP <dbl>, SE <dbl>, TO <dbl>, AF <dbl>, PAN <dbl>,
#   PAM <dbl>, AMZ <dbl>, CER <dbl>, CAA <dbl>, UNK <dbl>, tad_ext_morph <chr>, tad_int_oral_feat <chr>, tad_chond <chr>
# ℹ Use `print(n = ...)` to see more rows