amphiBR
Pacote R com dataset da publicação oficial da Lista de Anfíbios do Brasil publicada pela Sociedade Brasileira de Herpetologia
By Paulo Barros de Abreu Junior, Diogo Provete, Maurício Vancine, Juliana Zina in Projetos
March 15, 2023
amphiBR 
Pacote R com dataset da publicação oficial da Lista de Anfíbios do Brasil publicada pela Sociedade Brasileira de Herpetologia.
O dataset foi extraído da publicação por Segalla et al. (2021) na Revista Brasileira de Herpetologia, e disponível também no link https://zenodo.org/record/4716176
O objetivo deste pacote é facilitar a geração de listas de espécie para projetos, inventários de fauna, ou qualquer outro tipo de documento.
Dúvidas, críticas e sugestões são sempre bem-vindas!
Instalação
O pacote pode ser instalado diretamente do github:
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("paulobarros/amphiBR")
library(amphiBR)
Dataset
O dataset consiste de 1188 linhas com 49 colunas:
order - Ordem
family - Família
subfamily - Subfamília
sp_num - Número da espécie na lista
genus - Gênero
epithet - Epíteto específico
species - Nome científico
author - Autoria
status - Observações
category - Cateogoria de Ameaça pela Portaria MMA 300/2022
O dataset é automaticamente carregado junto com o pacote e pode ser acessado diretamente:
> segalla2021
# A tibble: 1,188 × 49
species_id order family subfamily genus epithet species author status common_name_br category endemic_br AC AL AP AM BA
<dbl> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 1 Anura Alloph… NA Allo… relicta Alloph… Caram… NA NA DD Yes 0 0 0 0 1
2 2 Anura Alloph… NA Allo… resple… Alloph… Castr… NA Resplendent F… LC No 0 0 0 1 0
3 3 Anura Alloph… NA Allo… ruthve… Alloph… Gaige… NA NA LC No 0 0 1 1 0
4 4 Anura Alsodi… NA Limn… macrog… Limnom… (Dumé… NA Rãzinha-de-co… LC No 0 0 0 0 0
5 5 Anura Aromob… Allobati… Allo… bacurau Alloba… Simõe… NA NA LC Yes 0 0 0 1 0
6 6 Anura Aromob… Allobati… Allo… brunne… Alloba… (Cope… NA Chapada Rocke… NT Yes 0 0 0 0 0
7 7 Anura Aromob… Allobati… Allo… caerul… Alloba… (Lima… NA NA LC Yes 0 0 0 1 0
8 8 Anura Aromob… Allobati… Allo… caldwe… Alloba… Lima,… recen… NA NA NA NA NA NA NA NA
9 9 Anura Aromob… Allobati… Allo… carajas Alloba… Simõe… NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10 10 Anura Aromob… Allobati… Allo… conspi… Alloba… (Mora… NA NA LC No 1 0 0 0 0
# ℹ 1,178 more rows
# ℹ 32 more variables: CE <dbl>, DF <dbl>, ES <dbl>, GO <dbl>, MA <dbl>, MT <dbl>, MS <dbl>, MG <dbl>, PA <dbl>, PB <dbl>, PR <dbl>,
# PE <dbl>, PI <dbl>, RJ <dbl>, RN <dbl>, RS <dbl>, RO <dbl>, RR <dbl>, SC <dbl>, SP <dbl>, SE <dbl>, TO <dbl>, AF <dbl>, PAN <dbl>,
# PAM <dbl>, AMZ <dbl>, CER <dbl>, CAA <dbl>, UNK <dbl>, tad_ext_morph <chr>, tad_int_oral_feat <chr>, tad_chond <chr>
# ℹ Use `print(n = ...)` to see more rows
- Posted on:
- March 15, 2023
- Length:
- 3 minute read, 461 words
- Categories:
- Projetos
- See Also:
- Land-use changes and the expansion of biofuel crops threaten the giant anteater in southeastern Brazil
- ATLANTIC AMPHIBIANS: a data set of amphibian communities from the Atlantic Forests of South America
- Impacts of mining activities on the potential geographic distribution of eastern Brazil mountaintop endemic species